Occurrence of Eukaryotes in the size fraction >300 micrometres, collected worldwide during the Tara Oceans expedition (2009-2013) using a Multinet and analysed on a ZooScan imaging platform

Tara expeditions (2009-2013) sampled the world’s oceans with standardized protocols, putting an exceptional effort into sampling plankton diversity across a large size range, using a combination of water samples and net tows. The efforts to explore the genomic diversity of plankton, through metabarcoding and metagenomics, have led to well publicized papers and have made the renown of Tara. While a similar extensive effort has been put on imaging, the datasets are not public yet. In a limited number of stations, in addition to the usual 5μm -> ~5cm Tara sampling strategy, multinet trawls allowed to sample the vertical distribution of plankton; this is the content of this dataset. Using a 300µm mesh net, it cover organisms from 300µm to ~3cm.

Identificatie

Versiedatum 2020-11-26
Type versiedatum Publicatie: Uitgavedatum van de dataset.
Dataset identificator

Inhoud

Contactgegevens dataset(serie)

Organisatie Sorbonne Université/CNRS, Laboratoire d'Océanographie de Villefranche
Rol Verstrekker: Organisatie die de data verstrekt.

Contactgegevens dataset(serie)

Organisatie Sorbonne Université/CNRS, Laboratoire d'Océanographie de Villefranche
Rol Verstrekker: Organisatie die de data verstrekt.

Contactgegevens dataset(serie)

Organisatie Department of Marine Ecology
E-mail office@iopan.gda.pl
Rol Verstrekker: Organisatie die de data verstrekt.

Contactgegevens dataset(serie)

Organisatie Sorbonne Université/CNRS, Laboratoire d'Océanographie de Villefranche
Rol Verstrekker: Organisatie die de data verstrekt.

Contactgegevens dataset(serie)

Organisatie Sorbonne Université/CNRS, Laboratoire d'Océanographie de Villefranche
Rol Verstrekker: Organisatie die de data verstrekt.

Contactgegevens dataset(serie)

Organisatie Sorbonne Université/CNRS, Laboratoire d'Océanographie de Villefranche
Rol Verstrekker: Organisatie die de data verstrekt.

Contactgegevens dataset(serie)

Organisatie Sorbonne Université/CNRS, Laboratoire d'Océanographie de Villefranche
Rol Verstrekker: Organisatie die de data verstrekt.

Contactgegevens dataset(serie)

Organisatie Sorbonne Université
Rol Producent: Partij die de data heeft aangemaakt.

Contactgegevens dataset(serie)

Organisatie Sorbonne Université
Rol Producent: Partij die de data heeft aangemaakt.

Contactgegevens dataset(serie)

Organisatie Sorbonne Université/CNRS, Institut de la Mer de Villefranche
Rol Producent: Partij die de data heeft aangemaakt.

Contactgegevens dataset(serie)

Organisatie Sorbonne Université
Rol Producent: Partij die de data heeft aangemaakt.

Contactgegevens dataset(serie)

Organisatie Sorbonne Université/CNRS, Laboratoire d'Océanographie de Villefranche
Rol Producent: Partij die de data heeft aangemaakt.

Contactgegevens dataset(serie)

Organisatie Sorbonne Université
Rol Producent: Partij die de data heeft aangemaakt.

Contactgegevens dataset(serie)

Organisatie Sorbonne Université/CNRS, Laboratoire d'Océanographie de Villefranche
Rol Verstrekker: Organisatie die de data verstrekt.

Contactgegevens dataset(serie)

Organisatie Department of Marine Ecology
E-mail office@iopan.gda.pl
Rol Producent: Partij die de data heeft aangemaakt.

Contactgegevens dataset(serie)

Organisatie Sorbonne Université
Rol Producent: Partij die de data heeft aangemaakt.

Contactgegevens dataset(serie)

Organisatie Sorbonne Université
Rol Producent: Partij die de data heeft aangemaakt.

Contactgegevens dataset(serie)

Organisatie Sorbonne Université/CNRS, Institut de la Mer de Villefranche
Rol Producent: Partij die de data heeft aangemaakt.

Contactgegevens dataset(serie)

Organisatie Sorbonne Université
Rol Producent: Partij die de data heeft aangemaakt.

Contactgegevens dataset(serie)

Organisatie Sorbonne Université/CNRS, Station Biologique de Roscoff
Rol Producent: Partij die de data heeft aangemaakt.

Contactgegevens dataset(serie)

Organisatie Sorbonne Université
Rol Producent: Partij die de data heeft aangemaakt.

Contactgegevens dataset(serie)

Organisatie Sorbonne Université
Rol Producent: Partij die de data heeft aangemaakt.

Contactgegevens dataset(serie)

Organisatie European Molecular Biology Laboratory
Rol Producent: Partij die de data heeft aangemaakt.

Contactgegevens dataset(serie)

Organisatie Centre for Marine Environmental Sciences
E-mail thor@marum.de
Rol Producent: Partij die de data heeft aangemaakt.

Contactgegevens dataset(serie)

Organisatie Sorbonne Université
Rol Producent: Partij die de data heeft aangemaakt.

Contactgegevens dataset(serie)

Organisatie Sorbonne Université
Rol Producent: Partij die de data heeft aangemaakt.

Contactgegevens dataset(serie)

Organisatie Sorbonne Université
Rol Producent: Partij die de data heeft aangemaakt.

Contactgegevens dataset(serie)

Organisatie Sorbonne Université
Rol Producent: Partij die de data heeft aangemaakt.

Contactgegevens dataset(serie)

Organisatie European Molecular Biology Laboratory
Rol Producent: Partij die de data heeft aangemaakt.

Contactgegevens dataset(serie)

Organisatie Tara Oceans Consortium
Rol Producent: Partij die de data heeft aangemaakt.

Trefwoorden

GEMET - INSPIRE themes, version 1.0 Bio-geographical regionsHabitats and biotopesSea regions
Ruimtelijk schema dataset(serie) tekstTabel: Tekstuele of tabelvormige data wordt gebruikt om geografische data te representeren.
Taal Engels
Categorie(ën) Biota,Milieu,Geowetenschappelijke informatie,Oceanen

Begrenzing

Omschrijving geografische begrenzing

Omschrijvende rechthoek

Minimum x-coordinaat -168.795583
Maximum x-coordinaat 158.068333
Minimum y-coordinaat -62.323333
Maximum y-coordinaat 79.35

Omschrijvende rechthoek

Minimum x-coordinaat -168.796
Maximum x-coordinaat 158.068
Minimum y-coordinaat -62.323
Maximum y-coordinaat 79.35
Identificator geografische begrenzing

Referentiesysteem

Horizontaal en/of verticaal referentiesysteem

Naam EPSG:4326

Kwaliteit

Niveau kwaliteitsinformatie Dataset: Informatie heeft betrekking op de dataset.

Bewerkingen

Algemene beschrijving herkomst Prior to publication data undergo quality control checked which are described in https://github.com/EMODnet/EMODnetBiocheck?tab=readme-ov-file#understanding-the-output

Conformiteit

Domeinconsistentie

Resultaat

Specificatie

Titel specificatie Technical Guidance for the implementation of INSPIRE dataset and service metadata based on ISO/TS 19139:2007
Titel Commission Regulation (EU) No 1089/2010 of 23 November 2010 implementing Directive 2007/2/EC of the European Parliament and of the Council as regards interoperability of spatial data sets and services
Versiedatum 2017-03-02
Type versiedatum Publicatie: Uitgavedatum van de dataset.
Versiedatum 2010-12-08
Type versiedatum Publicatie: Uitgavedatum van de dataset.
Uitleg This metadata set is non conformant with the Technical Guidance for the implementation of INSPIRE dataset and service metadata based on ISO/TS 19139:2007
Uitleg Conformance of this data set with the INSPIRE Implementing Rules for the interoperability of spatial data sets and services was not evaluated
Conform verklaard Nee

Toegangs- en gebruiksbeperkingen

Legale en veiligheidsbeperkingen

Beperkingen van de dataset(serie)

Legale beperkingen

(Juridische) gebruiksbeperking anders: Restrictie niet opgenomen in lijst.

Overige beperkingen

Overige beperkingen Attribution (CC BY)
Overige beperkingen Romagnan, J.B., Jalabert, L., Llopiz Monferrer, N., Merland, C., Trudnowska, E., Brandao, M., Elineau, A., Dimier, C., Picheral, M., Searson, S., Kandels-Lewis, S., Tara Oceans Consortium Coordinators, Karsenti, E., Pesant, S., Irisson, J.O., Lombard, F., Stemmann, L., Gorsky, G.; (2020) Occurrence of Eukaryotes in the size fraction >300 micrometres, collected worldwide during the Tara Oceans expedition (2009-2013) using a Multinet and analysed on a ZooScan imaging platform. <a href="https://doi.org/10.14284/517" target="_blank">https://doi.org/10.14284/517</a>

Beperkingen van de dataset(serie)

Legale beperkingen

(Juridische) toegangsbeperking anders: Restrictie niet opgenomen in lijst.

Overige beperkingen

Overige beperkingen There are no limitations on public access to spatial data sets and services.

Distributie

Distributieformaat XYZ ASCII

Overdracht

OnLine bronnen

Connectiepunt URL https://ecotaxa.obs-vlfr.fr/api/collections/by_short_title?q=tara-oceans-multinet-zooscan
Naam online information about the resource

OnLine bronnen

Connectiepunt URL https://emodnet.ec.europa.eu/geonetwork/srv/eng/catalog.search#/metadata/6d617269-6e65-696e-666f-000000006513
Naam online information about the resource

OnLine bronnen

Connectiepunt URL https://emodnet.ec.europa.eu/geoviewer/?layers=6d617269-6e65-696e-666f-000000001510:1:1&basemap=ebwbl&active=12639&bounds=-12530604,-7655416,12530604,7655416&filters=12639:datasetid__datasetid=6513--&projection=EPSG:3857
Naam online instructions for transferring data from one storage device or system to another

OnLine bronnen

Connectiepunt URL https://www.eurobis.org/toolbox/en/download/occurrence/dataset/6513
Naam online instructions for transferring data from one storage device or system to another

OnLine bronnen

Connectiepunt URL https://www.gbif.org/dataset/01883038-5ec6-4768-9d5b-8b6d56c314c0
Naam online instructions for transferring data from one storage device or system to another

OnLine bronnen

Connectiepunt URL https://geo.vliz.be/geoserver/Dataportal/wfs?service=wfs&version=1.1.0&typeName=eurobis-obisenv_full&request=GetFeature&outputFormat=text%2Fcsv&viewParams=datasetid%3A6513
Protocol OGC Web Feature Service
Naam INSPIRE Download Service (WFS)

OnLine bronnen

Connectiepunt URL https://geo.vliz.be/geoserver/wms?service=WMS&request=getCapabilities&layer=Dataportal:eurobis_rasters-obisenv
Protocol OGC Web Map Service
Naam INSPIRE WMS

OnLine bronnen

Connectiepunt URL http://ipt.vliz.be/eurobis/resource?r=dasid_6513
Naam online instructions for transferring data from one storage device or system to another

OnLine bronnen

Connectiepunt URL https://obis.org/dataset/e8f6f42e-0e33-4382-9998-9a178eac3191
Naam online instructions for transferring data from one storage device or system to another

Meta-metadata

Metadata identificator (fileIdentifier) 6d617269-6e65-696e-666f-000000006513
Taal metadatarecord Engels
Karakterset metadatarecord UTF-8: 8-bit variabele grootte universele karakterset, gebaseerd op ISO/IEC 10646
Hiërarchisch niveau Dataset: Informatie heeft betrekking op de dataset.
Metadata wijzigingsdatum 2025-03-26T00:00:00+01:00

Metadata-auteur

Organisatie Sorbonne Université/CNRS, Laboratoire d'Océanographie de Villefranche
Rol Contactpunt: Partij waarmee contact kan worden opgenomen voor het vergaren van kennis of verstrekking van de data.

Overviews